当过滤器的压差达到预设值时，将开始自动清洗过程，此间净水供应不断流，清洗阀打开，清洗室及吸污器内水压大幅度下降，通过滤筒与吸污管的压力差，吸污管与清洗室之间通过吸嘴产生一个吸力，形成一个吸污过程。同时，电力马达带动吸污管沿轴向做螺旋运动。吸污器轴向运动与旋转运动的结合将整个滤网内表面完全清洗干净。整个冲洗过程只需数十秒钟。排污阀在清洗结束时关闭。过滤器开始准备下一个冲洗周期。
净水器的核心就是它的滤芯，所以消费者最关心的也是净水器滤芯的使用时间。净水器采用的滤芯大致有：RO反渗透膜、超滤膜、PP棉滤芯、活性炭滤芯等。其中起精过滤的PP棉滤芯和活性炭滤芯净水器本身出认为损坏外一般不会出什么问题，可是其内部的滤芯，净水器滤芯属于消耗品，会有一定的使用寿命，净水器滤芯的使用寿命主要与水量的多少和水质情况而定。水处理量大、使用频率高的净水器，更换滤芯的时间相应就短些;水处理量小、使用频率高的净水器，更换滤芯的时间相应就长些。水质较好的地方，净水器滤芯的更换周期就长些;水质较差的地方，滤芯可能较容易堵塞，需要清洗，净水器滤芯更换周期就会缩短。
用0.5μmCF全硅藻微孔陶瓷滤芯能去除水中大于0.5μm铁锈、红虫 和浮游物及颗料物质，澄清水源;用5μmCTO压粘棒状活性炭滤芯可有 效吸附水中异色异味，部分除掉有机，无机杂质，可有效吸附水中的 余氯，改善水的口感;用0.1μmCF全硅藻微孔陶瓷滤芯:能去除水中大 于0.1μm的大肠杆菌、沙门氏菌、金葡萄球菌、绿脓杆菌和霉菌致菌;用PPF聚炳烯纤维+UDF椰壳颗粒活性炭双级滤芯能去除水中异色异 味，使净化水有甘醇甜美新鲜水的口感。适应一般自来水水源，配合 前预处理工艺，经处理过的水达到CJ94-1999饮用净水水质标准的净 水，可直接生饮，比三级过滤口感好。
